Séparation des chromosones se touchant ou se chevauchant à partir de métaphases

Abstract

Les système de classification automatiques des chromosomes ne peuvent pas traiter des images composant des chromosomes se touchant ou se chevauchant, d'où la nécessité d'une technique qui permet de les séparer automatiquement. L'idée à l'origine consiste à exploiter les squelettes et les contours des objets chromosomiques (chevauchement ou contact) dans le but de détecter les points de coupe et réaliser les lignes de séparation. Avant d'arriver à ce stade, le bruit est éliminé en effectuant un prétraitement et l'image est binarisée puis segmentée afin d'isoler chaque objet chromosomique séparément. Une fois que les points de coupes sont détectés, nous nous sommes retrouvés confrontés à un problème inhérent au nombre de ligne de séparation qui dépasse dans certains cas le nombre exact. Pour cela nous avons utilisé des mesures de concavité du contour afin de retrouver les vrais points de coupes, et ainsi les vraies lignes de séparation.